交通运输是经济社会发展的先行官，客流、货流也吸引了财流集聚。“南京市以集聚高级资源和改善营商环境为导向，集聚枢纽偏好型产业，打造南京空港、海港、高铁港枢纽经济区，加快自贸区、保税区、综保区等平台建设，促进交通、产业和城市融合发展。
在龙潭港港区四期集装箱码头，140余万平方米的货场堆满了五颜六色、大小不等的集装箱，岸桥吊具起起落落，拖车（车行业分析报告）在堆场和码头间来来回回，一派繁忙景象。随着南京市“连长江、通欧亚、对接沿海、辐射中西部”多式联运示范工程建设不断加快，创建期末南京市沿海沿江港口集装箱通过能力占比达26.11%，港口物流成为南京融入全球竞合格局的重要支撑。
临港产业聚集态势也由此显现。目前，龙潭国际综合物流集聚区已完成苏商保税物流、联讯综合物流、京亚供应链、安宏基物流等项目建设并投入运营；南京江北海港枢纽经济区保税物流中心（B型）项目已开工建设；南京空港跨境电子商务产业园主体基本完工……来自海外的水果、红酒等产品以更亲民的价格越来越多出现在南京市场上，企业和老百姓都得到了更多实惠。
南京市物流组织模式也在不断创新。在创建期末，南京市累计新增甩挂车辆821辆、新增甩挂线路7条；8家部省级“无车承运人”企业累计完成运单630万单、完成货运量1.3亿吨；社会物流总费用与GDP比率下降至13.7%，货车空驶率降低10%，平均找货时间由2.27天降为0.42天；乡镇快递网点覆盖率在全国率先达到100%……多层次的货运物流发展格局对经济社会发展的服务能力在不断增强。