上海、深圳相继出台的地方性房地产市场调控政策并不是房地产政策工具发挥作用的阶段性完结。在与四个特大型城市积极沟通要求必须确保房地产市场稳定的同时，作为房地产的主管部门，住房和城乡建设部(下称“住建部”)又将目光盯准了房地产中介机构。住建部已经确定，在年内开展一次专门针对房地产中介机构的大规模专项整顿治理行动。据悉，专项治理整顿的范围和力度，都将超过以往。对房地产中介结构严管的态势，已经在资本层面产生影响，已经有部分投资机构暂停和推迟了对部分房地产中介机构的投资计划。由首付贷引发的房地产（房地产行业分析报告）中介机构的政策高压，将在2016年全年持续。
按照过往类似工作的开展方式，专项治理整顿将采取部机关统一部署、地方逐级落实的方式。一般情况下将分为三个阶段：中央主管部门统一部署、地方政府自查自纠、中央主管部门督查及检查三个阶段。从2015年底开始，深圳、上海房地产市场相继呈现出上涨态势。国家统计局对70个大中城市2月房地产市场的监测显示，深圳、上海、北京三个特大型城市房价环比上涨幅度位列全国前三位，此间，住建部多次与上述三城市沟通，要求地方政府一定要保证当地房地产市场的稳定和健康发展。多位接近住建部的人士证实，面对2015年底以来的特大型城市的房地产市场异动，中央各相关部门对市场异动的成因进行了多次探讨与分析，主流意见认为，房地产市场中以首付贷、消费贷为表现形式的房地产市场配资行为，在一定程度上助涨了特大型城市的房地产市场，并蕴含着较大的系统性金融风险。
由于首付贷、消费贷等基本以房地产中介机构为渠道发放，因此，从监管层的角度，认为房地产中介机构是当前房地产市场异动的主要原因之一，因此，住建部决议对中介机构进行大范围的专项治理整顿。按照目前住建部的工作计划，针对房地产中介机构的专线治理整顿工作的重点已经基本划定。已经基本划定的专项治理整顿工作的重点，几乎完全覆盖房地产中介业务的全部环节已经确定的房地产中介机构专项治理整顿工作主要涉及7个方面的的内容，方式上将采用巡回检查、抽查、受理群众投诉等方式进行。这七方面的内容，涵盖了房地产中介业务的所有链条环节。首先是规范房源发布，重点查处虚假房源、隐瞒房屋抵押状况、查封状况，对房源信息的准确性进行规范，要求提供准确、全面、真实、及时的房源信息，确保房地产交易秩序的稳定、健康。其次是要求全面建立存量房网签制度，通过全面网签的方式，有效防止一房多卖等形式的侵害购房者权益的现象。目前，北京、上海、深圳、广州等特大型、大型城市基本实现了二手房交易的网签，但是，部分三四线城市的网签制度尚未建立健全。第三和第四个重点，是对中介机构的资金和资质进行统筹规范管理。在房地产主管部门通过备案管理后，房地产中介机构才能获得网签、房源核验等相关权限。同时，切实加强房地产交易资金的监管，防止中介机构侵占、挪用房地产交易人的交易资金，保证资金安全。除上述四方面外，住建部的整顿重点还在于，加强中介从业人员的管理，提高从业人员的素质。现在中介从业人员整体素质不高，要加大培训力度，倡导中介从业人员恪守职业道德、恪守职业规范。对那些违背从业人员职业道德，比如诱导或者协助当事人通过提供伪造的书面材料逃避相关部门的监管，从中获取不正当利益的行为，要会同有关部门进行严肃查处。此外，还要完善信用信息系统，建立中介机构从业人员的信用档案制度。将不良的、违法违规的中介机构和从业人员纳入系统中，形成黑名单，建立一个失信惩戒机制，提醒广大的购房消费者审慎地选择中介机构。