在探明籼稻与粳稻生殖隔离、杂种不育的机制后，可以通过分子标记辅助选择等手段规避花粉败育问题，从而推进水稻亚种间超强优势利用和高产品种的培育。这一研究扩大了水稻杂交的范围，为不同亚种之间的杂交提供了理论支持。利用本次研究成果，可以推进水稻亚种间杂交稻高产品种的培育。
现代水稻育种无意中将这对基因从籼稻引入粳稻后，其在粳稻种群中快速扩散，进一步说明了这对基因的“基因驱动”特性。利用这一特性，研究人员可以将优良基因，如优质、高抗、耐逆等基因与这对基因串联，驱动这些优良基因在后代群体中快速传播和纯合，从而大大缩短育种时间，提高育种效率，精准获得具有多种优良特性的水稻新品种。
在未来，我们可以通过分子设计的方式，精准地设计和培育我们需要的品种。破解籼稻和粳稻亚种间的生殖隔离，实现籼、粳杂种优势利用，是水稻育种中一次里程碑式的进步，这使得我们朝着水稻单产的再次飞跃又前进了一大步。“破坏者”和“守护者”这对基因在最开始的祖先野生稻中并不存在，随后演化出无功能的销售（销售行业分析报告）类型，最后在亚洲栽培稻的祖先——普通野生稻中进化出“破坏者”和“守卫者”功能。
在普通野生稻中形成之后，经过人类的驯化，这对基因仅被部分籼稻农家种继承，而粳稻农家种可能因为地缘不同没有继承。由于这对基因在水稻种间或亚种间的分布不均，因此水稻种间或亚种间相互杂交产生花粉不育就成为了一个普遍现象。
在世代繁衍过程中，当携带这对基因和不携带这对基因的水稻植株进行杂交，得到的杂交植株中，凡是不携带这对基因的花粉都不能正常发育。换言之，凡是发育正常的花粉都携带这对基因。因此，随着世代的增加，含有这对基因的后代个体会迅速增加，最终占主导地位，这种遗传效应被称为“基因驱动”。