侵权品种多样，是涉种侵权案件的特点之一。从已受理的侵权案件看，侵权品种从以小麦、水稻、玉米等主要农作物为主，逐渐扩展到通过扦插进行扩繁的薯类、果树等品种。
水稻是涉种侵权的重点品种。去年下半年，长三角地区一市公安机关侦破邓某某等侵犯种业商业秘密案被公开通报。该案共查获侵权稻种6吨。经查，邓某某系某种业公司的制种合作方，其违反保密协议，伙同他人私自截留稻种亲本并非法组织种植，将产出的稻种交由另一家公司更换品牌包装后对外销售。
侵权方式多样，是一些地方种业侵权扰企坑农的明显特征。有的侵权人直接售卖侵权品种，有的“挂羊头卖狗肉”，售卖不标注品种名称的“白皮包”种子，或通过标注其他品种名称“套牌”销售被侵权种子，有的还销售“掺混”种子。除侵权品种和方式多种多样外，侵权主体也呈现不断延伸态势。业内人士指出，侵权主体从专业制种公司及种子经营门店，扩展到农业（农业行业分析报告）合作社、种粮大户等，甚至存在重复侵权现象。一家种业龙头企业法务部经理表示，公司选育的优势品种被不同主体侵权，侵权环节多样化，不仅有市场环节的侵权，还包括从制种源头到售种终端多环节侵权。
种业侵权“花样翻新”，带来了多方面危害，不仅侵犯了权利人的合法权益，还阻碍了我国种业产业的做大做强。中国科学院院士、崖州湾国家实验室副主任钱前认为，种业企业创制一个新品种可能需要十年到二十年时间，如果原始创新屡屡被侵权，势必会影响企业创新积极性。缺乏核心知识产权，也会阻碍我国种业产业做大做强，因此要充分认识到保护种业知识产权的重要性。
种业侵权还会扰乱市场经营秩序，影响市场公平竞争。多家种子公司负责人说，种子的质量无法得到保障，会带来粮食减产的现实风险，继而将给农民造成经济损失。