针对一批经营主体反映强烈的限制企业迁移、设置进入壁垒、谋求自我小循环等行为，此次清理工作进行了重点治理。 在重点清理的几类问题中，涉及妨碍市场准入和退出的1917件，占45.44%；涉及妨碍商品和要素自由流动的568件，占13.47%；涉及不当影响生产经营成本的1462件，占34.67%；涉及不当影响生产经营行为的121件，占2.87%；因文件到期废止等其他情况作出调整的150件。
此次清理发现，涉及妨碍市场准入和退出、影响生产经营成本等领域问题的占比，较前次清理分别增加10.02和16.01个百分点，涉及妨碍商品和要素自由流动领域问题仍然较为突出；问题表现形式多以隐性为主，各种“土门槛”“土政策”多发，规范性文件和“一事一议”等其他政策方案（方案行业分析报告）措施占绝大多数，“边清理、边出台”和“绕开”公平竞争审查等问题仍然存在。
公平竞争审查制度的落实还存在“上热”“中温”“下冷”现象，尤其是市县两级政府部门不当干预市场的行为还有待进一步规范。部分地方政府囿于短期发展和局部利益，还没有全面准确把握全国统一大市场和地方竞争发展的关系。