木薯和马铃薯、红薯等属于薯类食物，与米饭、馒头的原料大米、小麦(小麦行业分析报告）相比，木薯的加工程度较低，所以其膳食纤维、钾元素、维生素C和维生素B1的含量比米饭和馒头略胜一筹。此外，某些选育食用品种如华南9号（一种黄肉木薯），薯肉中还富含胡萝卜素。在如今琳琅满目的粗粮选择中，木薯的营养成分算不上有多优秀。
木薯中蛋白质含量低，每100克木薯所含的蛋白质仅有2.1克，低于同等重量的米饭（2.6克），比馒头（7克）更要低很多。特别是加工成木薯粉后，蛋白质含量仅0.08克/100克，维生素C和维生素B1含量分别为2.96毫克/100克和0.007毫克/100克。木薯淀粉中只有17%是直链淀粉，剩余的83%都是支链淀粉，支链淀粉独特的结构使它在糊化过程中更易吸水形成黏稠的胶体，从而形成软糯Q弹的口感。在我国广东、广西、海南等地，木薯常和椰子、糖搭配制作成各种甜点小吃。
支链淀粉大多数情况下可能会引起血糖升高的问题，而煮熟的木薯的血糖指数（GI）大约在60—85之间，属于中高血糖指数食物，虽然木薯淀粉制品口感弹牙，消化速度较慢，一般不会引起血糖快速上升，但木薯糖水是木薯和大量冰糖或黄糖混合煮成的，所以它对血糖并不“友好”，建议需要严格控制血糖的人少吃或尽量不吃木薯糖水。由于木薯淀粉不像马铃薯淀粉和红薯淀粉那么容易消化，所以有一部分会逃脱小肠消化酶的作用，被结肠内的细菌分解产生气体。对消化能力较弱、胃肠功能紊乱的人来说，有可能出现腹胀等问题。
社交平台上不乏网友分享的食用木薯甜品后的不适经历。刘少伟分析认为，食用木薯糖水后会出现不良反应，既可能是糖水糖分太高引起血糖升高导致头晕，也可能是原材料或烹饪过程中卫生不彻底导致其他污染，但更可能是氢氰酸中毒，即民间所说的“苦木薯醉人”。木薯中毒一般是急性且突发的，主要见于中枢系统和上呼吸道，表现为头痛、头晕、乏力、胸闷、恶心、呕吐等，出现这种情况要及时到医院就诊。通过正规渠道选择可食用木薯，这类木薯口感较甜、不带苦味儿，氢氰酸含量也都小于50毫克/千克。木薯切开后，如果发现果肉纤维变黑，说明品质不佳，不建议再吃；自制其他木薯甜品，可直接购买可食用木薯粉。